Captain Phillips adalah sebuah kisah nyata dari Kapten Richard Phillips yang mengalami pembajakan tahun 2009 oleh perompak Somalia. Selain itu kapal barang ini merupakan kapal barang Amerika pertama yang dibajak dalam waktu 200 tahun terakhir.
Kapal barang Amerika Serikat Maersk Alabama yang dinahkodai oleh Kapten Phillips (Tom Hanks) sedang melakukan perjalanan menuju Mombasa, Kenya. Secara tiba-tiba kapal ini dikepung oleh sekelompok perompak yang dipimpin oleh Muse (Barkhad Abdi).
Seluruh awak kapal Maersk Alabama berusaha menyelamatkan diri ke 'secure room' yaitu tempat yang telah disiapkan untuk insiden seperti ini. Kapten Phillips selaku kapten kapal itu juga bertanggung jawab akan segala hal terburuk yang akan menimpa awaknya, kapal, bahkan dirinya. Di saat menegangkan tersebut terjadi sebuah konflik antara Phillips dan Muse yang membuat keadaan semakin membahayakan.
